Različiti sastavi endotoksina mogu dovesti do tri oblika bakterijskog fenotipa, odnosno glatkog tipa, hrapavog tipa i srednjeg tipa (također nazvanog sluznog tipa). Kada je središnja polisaharidna komponenta smanjena ili oštećena, izgled kolonija bakterijske kulture je grub, pa se naziva grubi mutant (rough-LPS, R), koji se može nazvati Rb-LPS, Rc-LPS, Rd-LPS, Re -LPS prema stupnju defekta polisaharida jezgre, kao što je prikazano na slici .
Elektronski mikroskop Escherichia coli LPS s glatkim kolonijama je vitke vrpčaste strukture, dok je hrapavi tip Escherichia coli LPS uglavnom kružne strukture. Zbog različitih duljina njegovog šećernog lanca, proizvodit će se različiti učinci steričke smetnje, što će utjecati na prepoznavanje i fagocitozu LPS-a i CNB-a od strane imunoloških stanica tijela, tako da će domaćin imati različite imunološke učinke na njega i utjecati na čišćenje organizma od bakterija.
Šećerni lanac grubog tipa je kratak i lako ga gutaju fagociti, kao što su profesionalni fagociti: neutrofili i makrofagi, koje je lako ukloniti bakterije grubog tipa; Glatki šećerni lanac je dugačak, ima steričke smetnje, fagociti ga ne mogu lako progutati i spojiti s komplementom i lako je izbjeći imunološkom odgovoru tijela na njega.