Jednom kad se polimer O antigena poveže s jezgrom lipida A, zaustavit će reakciju polimerizacije. To jest, reakcija povezivanja može prekinuti reakciju polimerizacije. I jezgra lipida A i lipopolisaharid s različitim duljinama ponavljajućih jedinica mogu se učinkovito prenijeti na vanjsku membranu. Stoga se molekularna veličina lipopolisaharida može vidjeti pomoću SDS-PAGE, što je uzrokovano razlikom u sustavu biosinteze, a ne faktorom izlaznog sustava.

Distribucija bočnog lanca antigena O u različitim bakterijama je različita, od kojih neke sadrže oko 20 ponavljajućih jedinica, a neke mogu imati oko 100 ponavljajućih jedinica. U SDS-PAGE elektroforezi očituje se razlika u intenzitetu bojenja srebrom različitih molekula različitih vrsta bakterija. Razlog za različitu raspodjelu duljine bočnog lanca antigena O u različitim bakterijama može biti to što postoji čimbenik odabira veličine u procesu polikondenzacije antigena O ili reakcije povezivanja. Wzz (tj. Rol ili Cld) je važan protein koji regulira distribuciju duljine bočnog lanca u bakterijama koje sintetiziraju antigene preko Wzy ovisnog puta, ali njegov specifični mehanizam još uvijek nije jasan.